ИСИЭЗ выполняет фундаментальные и прикладные исследования междисциплинарного характера в таких областях, как: измерение науки, технологий, инноваций, образования и информационного общества; долгосрочное научно-технологическое прогнозирование (форсайт); моделирование поведения акторов инновационной системы; разработка доказательной научно-технической и инновационной политики, эффективных инструментов региональной кластерной политики и др.

Академическое ядро образуют две международные лаборатории — Лаборатория экономики инноваций под руководством профессора Дирка Майснера и Лаборатория исследований науки и технологий, которой руководит профессор Оздчан Саритас. 

В 2021 г. на базе Международного научно-образовательного Форсайт-центра ИСИЭЗ создана Кафедра ЮНЕСКО по исследованиям будущего.

Исследовательская инфраструктура ИСИЭЗ включает информационно-аналитические системы, базы данных технологических трендов, статистических показателей науки, технологий и инноваций и др. Собственное уникальное программное обеспечение позволяет проводить масштабные экспертные онлайн-опросы. База данных экспертов ИСИЭЗ включает более 13 000 ведущих российских и зарубежных специалистов. Для анализа динамики развития науки, технологий и инноваций и выявления возникающих трендов в ИСИЭЗ разработана не имеющая аналогов в России система интеллектуальной обработки больших данных iFORA.

В последние годы устойчиво растут объемы выполняемых исследований и разработок, а также публикационная активность сотрудников Института. Их статьи выходят в авторитетных международных журналах: Nature, Technovation, Technological Forecasting and Social Change, Scientometrics, Futures, Applied Energy, Energy Policy, The Journal of Technology Transfer, Foresight, International Journal of Innovation Management, Journal of International Entrepreneurship, Business Strategy and the Environment и др.

ИСИЭЗ интегрирован в глобальное академическое сообщество, имеет устойчивые партнерские отношения с международными организациями (ОЭСР, Евростат, Еврокомиссия, ЮНЕСКО, ЮНИДО, ЮНКТАД, АТЭС, Всемирный банк, МВФ, Международный научно-технический центр, Международный союз электросвязи, др.), ведущими университетами и исследовательскими центрами в более чем 20 странах мира. Участвует в международных исследовательских сетях и коллаборациях (ERA. Net RUS, Globelics, MEIDE, UniDev и др.).

Ведущие сотрудники Института состоят в экспертных группах и комитетах международных организаций, участвуют в разработке статистических стандартов (Руководство Фраскати и Руководство Осло) и подготовке знаковых аналитических докладов (Обзор науки, технологии и инноваций ОЭСР, Доклад ЮНЕСКО по развитию науки до 2030 года, Глобальный инновационный индекс (Корнельский университет/ Школа бизнеса INSEAD/ Всемирная организация интеллектуальной собственности) и др.).

ИСИЭЗ принимает активное участие в развитии международного научно-технического сотрудничества России с ЕС, а также странами ближнего и дальнего зарубежья посредством действующих в его структуре Центра международных проектов, Информационно-координационного центра по взаимодействию с ОЭСР и Национальных контактных точек «Мобильность», «Общество (INCO)», «Наука и общество» Рамочной программы ЕС «Горизонт 2020».

Каждую осень проводит Международную научную конференцию «Форсайт и научно-техническая и инновационная политика», которая признана ОЭСР одной из наиболее авторитетных дискуссионных площадок по этой проблематике. В рамках ежегодной Апрельской международной научной конференции НИУ ВШЭ по проблемам развития экономики и общества ИСИЭЗ организует специализированные мероприятия, посвященные обсуждению актуальной повестки исследований науки, технологий и инноваций в России и зарубежных странах.

ИСИЭЗ проводит экспертизу и готовит аналитику в области научно-технической и инновационной политики для Администрации Президента, Правительства, федеральных и региональных органов исполнительной власти, институтов развития, крупных компаний и вузов. Оказывает методическую поддержку федеральных статистических наблюдений в сфере науки, технологий и инноваций, образования, информационного общества. Формирует систему технологического прогнозирования и выявляет наиболее значимые для России области развития науки и технологий на долгосрочную перспективу.

Имеет большой опыт подготовки документов федерального и регионального уровня, в частности, стратегий социально-экономического развития регионов, программ инновационного развития и технологических дорожных карт для компаний, секторов экономики, программ развития кластеров.

Сотрудники ИСИЭЗ принимали участие в разработке Государственных программ РФ «Развитие науки и технологий» и «Развитие образования», Стратегии инновационного развития РФ на период до 2020 года, Стратегии научно-технологического развития РФ и др. Координировали разработку Прогноза научно-технологического развития РФ на период до 2030 года, Прогноза научно-технологического развития агропромышленного комплекса РФ до 2030 года и др.

ИСИЭЗ с 2014 года запустил англоязычную магистерскую программу ‘Governance of Science, Technology and Innovation’ и подписал соглашения о международном студенческом обмене с Сеульским национальным университетом (Республика Корея), Университетом Бремена (Германия) и Ближневосточным техническим университетом (Турция), а также о программах двойных дипломов с Берлинским техническим университетом (Германия), Университетом Маастрихта (Нидерланды) и Сеульским национальным университетом. По оценкам студентов, в 2015 году программа вошла в топ-5 лучших в НИУ ВШЭ.

ИСИЭЗ на регулярной основе проводит краткосрочные образовательные курсы по статистике, научно-технологической и инновационной политике и форсайту для сотрудников ведущих вузов, предприятий, государственных органов, в том числе из других стран. Институт организует ряд программ дополнительного образования, например, в данный момент реализует программу «Цифровизация деятельности HR и маркетинга».

ИСИЭЗ выпускает около 10 серий статистических сборников (в частности, ежегодные «Индикаторы науки», «Индикаторы инновационной деятельности», «Индикаторы образования», «Индикаторы цифровой экономики»); аналитические доклады («Прогноз научно-технологического развития России: 2030», «Пилотные инновационные территориальные кластеры в РФ» и др.); научные монографии и научно-методические материалы. С 2012 года ежегодно формирует Рейтинг инновационного развития субъектов РФ.

С 2007 года издает журнал «Форсайт» (Foresight and STI Governance), входящий в международную базу данных Scopus и занимающий ведущие позиции в Российском индексе научного цитирования (RSCI).

В 2014 году заключено соглашение с издательством Springer на выпуск под редакцией сотрудников ИСИЭЗ серии монографий 'Science, Technology and Innovation Studies'. К настоящему моменту в ней изданы 15 книг.

В рамках Программы фундаментальных исследований НИУ ВШЭ Институт издает собственную серию препринтов 'Science, Technology and Innovation'.

ИСИЭЗ регулярно выпускает информационные бюллетени по результатам ежегодных мониторинговых исследований («Мониторинг экономики образования», «Инновационная активность субъектов инновационного процесса», «Инновационное поведение населения»,  «Мониторинг рынка труда научных кадров высшей квалификации», «Деловая активность в промышленности, строительстве, сфере услуг», «Мониторинг развития сектора интеллектуальных услуг»); еженедельные бюллетени с экспресс-информацией о статистике науки, технологий, инноваций и развитии цифровой экономики; обзоры глобальных технологических трендов (трендлеттеры) и другие материалы, получающие широкое освещение в СМИ.